La resolución tomada por el Comando de la Armada designando a José Luis Elizondo como el nuevo Comandante, fue cuestionada por el ex-Senador de Cabildo Abierto Guido Manini Ríos, que consideró que la Ley debe respetarse o de lo contrario modificarse.

Recordó el contenido de la Ley Orgánica vigente de la Armada Nacional, que establece que el Comandante en Jefe debe pertenecer al cuerpo general y si bien no tiene dudas de la capacidad profesional y hombría de bien de Elizondo,  el cumplimiento de la Ley está primero. El freno más importante para su nombramiento radicaba en una discusión jurídica ya  que es el jerarca máximo de la Prefectura Naval, pero no es parte del cuerpo general de la Armada, requisito básico para ascender a Comandante. Elizondo estuvo al frente de la Prefectura del Puerto de Mercedes y será impuesto oficialmente en el cargo el próximo lunes al mediodía en las instalaciones de la Escuela Naval. Ejerció el Comando de las Prefecturas de los puertos de Carmelo, Mercedes y Nueva Palmira y también en Montevideo, Colonia y La Paloma.